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蛋白质序列分析路线图和工具都是什么?
1、蛋白质序列分析路线图是指为了对蛋白质的成分和形成原因进行分析,而沿着蛋白质的形成部位和形成过程进行跟踪的线路。
2、蛋白质序列分析工具如下:
(1) 跨膜区预测。
方法:输入待分析的蛋白序列即可。
(2) 信号肽预测。
方法:输入待分析的蛋白序列,如为原核基因选择原核训练集,否则选择真核训练集。
(3) 亚细胞定位预测。
推荐使用PSORT软件对PDCD5蛋白的细胞内定位进行预测。PSORT将动物蛋白质定位于10个细胞器:(1)细胞浆,(2)细胞骨架,(3)内质网,(4)胞外,(5)高尔基体,(6)溶酶体,(7)线粒体,(8)胞核,(9)过氧化物酶体(peroxisome)和(10)细胞膜。
蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说,蛋白质约占人体全部质量的18%,最重要的还是其与生命现象有关。蛋白质是生命的物质基础,是有机大分子,是构成细胞的基本有机物,是生命活动的主要承担者。
真核细胞亚细胞定位实验的原理及步骤?
原核细胞(Prokaryotic cells),也就是细菌等生物体的简单细胞,有时被比喻为单间小屋:它们没有内部膜,所以它们就像一个单间,没有墙壁可以分割。如果我们把这个类比扩展到真核细胞,也就是构成植物、真菌和动物的更复杂的细胞,我们会发现,它们在房地产市场上是绝对升值的。
就像一个大的家庭住宅被分割成许多不同用途的房间(卧室、浴室、厨房、起居室等),真核细胞也包含了各种不同的具有专门功能的隔间,彼此之间用膜层整齐地分开。这种组织方式让每个隔室都能保持自己的条件,也就是它开展工作所需要的条件。
例如,被称为溶酶体(lysosomes)的隔室,作为细胞的回收中心,必须保持一个酸性的pH值,以处理细胞废物。同样,被称为过氧化物酶体(peroxisomes)的结构也会进行被称为氧化反应的化学反应,并产生过氧化氢,如果不把它们安全地存放在自己的 "房间 "里,这两种物质都会损害细胞。
在一个细胞内保持不同环境的能力,使得真核细胞可以进行复杂的代谢反应,而原核生物则不能。事实上,这也是为什么真核细胞可以长到比原核细胞大很多倍的重要原因。
原核细胞对比真核细胞
真核细胞的主要特征是什么?与原核细胞不同,真核细胞具有:
一个膜结合的细胞核(nucleu),一个被膜包围的中央空腔,里面有细胞的遗传物质。
一些膜结合的细胞器(organelles),是漂浮在细胞液中的具有特殊功能的细胞室。细胞器的意思是 "小器官",这个名字反映了细胞器就像我们身体的器官一样,作为一个更大系统的一部分,具有独特的功能。
多条线型染色体(linear chromosomes),而不是原核生物的单条圆形染色体(single circular chromosome)。
真核细胞比原核生物的细胞要复杂得多。它们充满了一系列迷人的亚细胞结构,在能量平衡、新陈代谢和基因表达方面发挥着重要作用。
怎么亚细胞定位分析
用报告基因技术呀 比如说最常用的绿色荧光蛋白GFP或者改造过的EGFP等.和目的基因构建成为融合蛋白,转入细胞中以后,用激光扫描共聚焦显微镜就可以观察到基因的亚细胞定位
亚细胞定位
亚细胞定位是指某种蛋白或表达产物在细胞内的具体存在部位。如仅在核内存在,还是胞质内存在,还是细胞膜上存在。
GFP实际是给你要研究的物质加上标记。使用GFP必须构建融合蛋白载体,并有效表达。这样在荧光显微镜下,如果看到细胞内某一部位存在GFP信号,则说明和GFP融合的蛋白也存在于该部位,这样就达到了确定某物质亚细胞定位的目的。
谁用过wolf psort蛋白质亚细胞定位预测软件
预测蛋白质的亚细胞定位,是通过生物信息学的方法的。
或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过亚细胞定位的实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。
不同物种,不同基因家族成员有可能有区别。