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亚细胞定位
亚细胞定位是指某种蛋白或表达产物在细胞内的具体存在部位。如仅在核内存在,还是胞质内存在,还是细胞膜上存在。
GFP实际是给你要研究的物质加上标记。使用GFP必须构建融合蛋白载体,并有效表达。这样在荧光显微镜下,如果看到细胞内某一部位存在GFP信号,则说明和GFP融合的蛋白也存在于该部位,这样就达到了确定某物质亚细胞定位的目的。
真核细胞亚细胞定位实验的原理及步骤?
原核细胞(Prokaryotic cells),也就是细菌等生物体的简单细胞,有时被比喻为单间小屋:它们没有内部膜,所以它们就像一个单间,没有墙壁可以分割。如果我们把这个类比扩展到真核细胞,也就是构成植物、真菌和动物的更复杂的细胞,我们会发现,它们在房地产市场上是绝对升值的。
就像一个大的家庭住宅被分割成许多不同用途的房间(卧室、浴室、厨房、起居室等),真核细胞也包含了各种不同的具有专门功能的隔间,彼此之间用膜层整齐地分开。这种组织方式让每个隔室都能保持自己的条件,也就是它开展工作所需要的条件。
例如,被称为溶酶体(lysosomes)的隔室,作为细胞的回收中心,必须保持一个酸性的pH值,以处理细胞废物。同样,被称为过氧化物酶体(peroxisomes)的结构也会进行被称为氧化反应的化学反应,并产生过氧化氢,如果不把它们安全地存放在自己的 "房间 "里,这两种物质都会损害细胞。
在一个细胞内保持不同环境的能力,使得真核细胞可以进行复杂的代谢反应,而原核生物则不能。事实上,这也是为什么真核细胞可以长到比原核细胞大很多倍的重要原因。
原核细胞对比真核细胞
真核细胞的主要特征是什么?与原核细胞不同,真核细胞具有:
一个膜结合的细胞核(nucleu),一个被膜包围的中央空腔,里面有细胞的遗传物质。
一些膜结合的细胞器(organelles),是漂浮在细胞液中的具有特殊功能的细胞室。细胞器的意思是 "小器官",这个名字反映了细胞器就像我们身体的器官一样,作为一个更大系统的一部分,具有独特的功能。
多条线型染色体(linear chromosomes),而不是原核生物的单条圆形染色体(single circular chromosome)。
真核细胞比原核生物的细胞要复杂得多。它们充满了一系列迷人的亚细胞结构,在能量平衡、新陈代谢和基因表达方面发挥着重要作用。
为了更好研究HD1基因的亚细胞定位,我们构建了含有35s启动子:HD1-GFP的双元载体
这是动物还是植物细胞工程?看起来像植物,双元载体的话,质粒应该比较大,应该不是打基因枪或是原生质体了,一般是用农杆菌侵染烟草表皮瞬时转化吧。有很多protocol,我就提供一份我用过的吧:
1 载体转化入农杆菌;2 工程菌单克隆于YEB培养基 28℃,过夜培养;3. 1%扩大培养于新培养基(YEB+100uM AS+ 10mM Mes【pH5.7】);4 收集农杆菌,用注射液(10mM MgCl2+10mMMes【pH5.7】)+20uM AS;)将农杆菌稀释至OD600=1左右,室温活化3h;5 用注射器注射烟草成熟叶片; 6 避光2-3天; 7 Confocal 观察
成败关键:1 农杆菌菌株毒力强一点好EHA105,GV3101比较好,LBA404不好;2 AS诱导;3 农杆菌需要一定时间活化; 4 所用烟草要健康,叶片要大而平整,方便注射
烟草亚细胞定位没有信号
烟草亚细胞定位有信号
真核细胞和原核细胞的区别是看是否有以核膜为界的细胞核。 按照以前老教材的解释就是:原核细胞是没有核膜包围的细胞核的。 在真核细胞中细胞核内是有细胞质存在的。在原核细胞中由于没有核膜包围的细胞核,所以细胞质是可以和细胞核相互依存的。预测蛋白质的亚细胞定位,是通过生物信息学的方法的。
或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过亚细胞定位的实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。