课程:
- 1、我知道基因的locus name,和定位信息,怎么做出来基因定位到染色体的图那,133个基因伤不起啊
- 2、如何将10bp的DNA序列在人染色体上定位并图形化显示
- 3、如何做出基因在染色体上的分布图
- 4、如何应用连锁图谱定位染色体上的某个基因
我知道基因的locus name,和定位信息,怎么做出来基因定位到染色体的图那,133个基因伤不起啊
在NCBI主页上,选好基因后,下边有个genomic context,右侧有个mapviewer。你设置一下可以看到同一染色体的许多基因。
如何将10bp的DNA序列在人染色体上定位并图形化显示
构建遗传连锁图谱的软件好多
不同的软件作出的图大差不差
一般常用的有linkagemap1.0或者mapmaker 3.0
南京的去南林大找吧
去林木遗传育种实验室
生物技术大楼5楼
他们作图做的很多
这些软件都很齐全
网上也有免费的软件下载
照你的意思的话你是要作物理图谱
物理图谱的目的就是用分子生物学技术直接将DNA分子标记或基因定位在基因组的实际位置
你那些10bp的DNA序列也就是相当于分子标记
但是物理图的构建比遗传图谱复杂多了
你这个可以采用荧光原位杂交FISH来作图
将10bp的DNA互补序列做成探针直接与染色体进行杂交
通过荧光标记将序列直接显示出位置
STS作图是目前最有效的物理作图方法
通常使用的软件是由Phil Green小组的C. L. Magness等人编写的SEGMAP
物理图谱我没做过不是很清楚
我只能帮你这么多了
如何做出基因在染色体上的分布图
遗传连锁图绘制软件MapDraw 2.1
上有下载。
使用时打开那个Excel文件,把基因名称和相对位置写上(上面有例子)。需要把Excel的宏的安全性设为中等。选定数据范围,然后选择工具-宏-宏-选择Mapdraw。
如何应用连锁图谱定位染色体上的某个基因
如果是数量性状,连锁图谱结合表型数据,利用QTLnetwork2.0软件就可以做了,如果是质量性状,利用Mapmaker/Exp 3.0