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如何预测蛋白质的亚细胞定位
如何预测一个基因的亚细胞定位
预测蛋白质的亚细胞定位,是通过生物信息学的方法的。
或者你在NCBI数据库中比对到了编码类似蛋白的基因,如果该基因有人做过亚细胞定位的实验,你也可以大概知道其编码的蛋白质在细胞内部的定位。不同物种,不同基因家族成员有可能有区别。最终还是需要实验来验证的。
功能基因研究中,经常会进行基因编码的蛋白质的亚细胞定位的,
如待定位蛋白和GFP、YFP、RFP等融合后,观察融合蛋白在细胞内的定位,
或者将预测部位(如该蛋白可能在液泡膜上)的蛋白提取出来,进行western实验,来验证等。
希望对你有帮助吧
DFP亚细胞定位主要用作什么方面?可以打个比方么?
难道又推出新的荧光蛋白了?目前主要用作亚细胞定位的是GFP绿色萤光蛋白,就是因为这个今年3个哥们得了诺贝尔化学奖。
亚细胞定位就是看目的基因的表达产物被定为在细胞的哪个位置,比如细胞核或细胞质。
操作上一种方法是在你要表达的基因上加上高效启动子和一段GFP序列,用基因枪将你整合的序列打入一些植物组织,比如洋葱表皮,培养一小段时间。荣荧光显微镜观察,相应的亚细胞结构会呈现绿色。以此来判断你要研究的基因产物在细胞中位置。
真核细胞亚细胞定位实验的原理及步骤?
原核细胞(Prokaryotic cells),也就是细菌等生物体的简单细胞,有时被比喻为单间小屋:它们没有内部膜,所以它们就像一个单间,没有墙壁可以分割。如果我们把这个类比扩展到真核细胞,也就是构成植物、真菌和动物的更复杂的细胞,我们会发现,它们在房地产市场上是绝对升值的。
就像一个大的家庭住宅被分割成许多不同用途的房间(卧室、浴室、厨房、起居室等),真核细胞也包含了各种不同的具有专门功能的隔间,彼此之间用膜层整齐地分开。这种组织方式让每个隔室都能保持自己的条件,也就是它开展工作所需要的条件。
例如,被称为溶酶体(lysosomes)的隔室,作为细胞的回收中心,必须保持一个酸性的pH值,以处理细胞废物。同样,被称为过氧化物酶体(peroxisomes)的结构也会进行被称为氧化反应的化学反应,并产生过氧化氢,如果不把它们安全地存放在自己的 "房间 "里,这两种物质都会损害细胞。
在一个细胞内保持不同环境的能力,使得真核细胞可以进行复杂的代谢反应,而原核生物则不能。事实上,这也是为什么真核细胞可以长到比原核细胞大很多倍的重要原因。
原核细胞对比真核细胞
真核细胞的主要特征是什么?与原核细胞不同,真核细胞具有:
一个膜结合的细胞核(nucleu),一个被膜包围的中央空腔,里面有细胞的遗传物质。
一些膜结合的细胞器(organelles),是漂浮在细胞液中的具有特殊功能的细胞室。细胞器的意思是 "小器官",这个名字反映了细胞器就像我们身体的器官一样,作为一个更大系统的一部分,具有独特的功能。
多条线型染色体(linear chromosomes),而不是原核生物的单条圆形染色体(single circular chromosome)。
真核细胞比原核生物的细胞要复杂得多。它们充满了一系列迷人的亚细胞结构,在能量平衡、新陈代谢和基因表达方面发挥着重要作用。
亚细胞定位用gfp号还是yfp好
YFP和GFP其实是序列基本相同的两种蛋白
GFP就是绿色荧光蛋白,YFP就是Thr203以Tyr取代,发出黄色的荧光,成为黄色荧光蛋白
因此两者最大的区别则是发射波长了
亚细胞定位用YFP或者GFP都是可以的
需要考虑:
如果是标记在N端很可能影响定位
如果是红色的探针,选用绿色GFP比较经典,两者叠合的橙色也是很多文献上常采用的。但如果是蓝色的探针,则选用黄色YFP比较容易区分一点